Lehrstuhl für Molekulare Physikalische Chemie
Willkommen auf den Seiten des Lehrstuhls für Molekulare Physikalische Chemie an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf.
Aktuelles
Posterpreis für Milana Popara
Poster: FRET-assisted structure prediction
Autoren: Alexander Larbig, Bianca Reschke, Milana Popara, Mykola Dimura, Daniel Mulnaes und Claus A.M. Seidel
Poster im Rahmen der "Remote BioExcel Summer School on Biomolecular Simulations 2020", organisiert von BioExcel: Centre of Excellence for Computational Biomolecular Research
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Mykola Dimura hat seine Dissertation, mit dem Titel "Efficient FRET-assisted computational structural modelling", mit Auszeichnung abgeschlossen . Herzlichen Glückwunsch !!
Soheila Rezaei Adriani hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Understanding molecular mechanism and structural properties of small GTPase-mediated effector activation", erfolgreich abgeschlossen . Herzlichen Glückwunsch !!
Titel: Resolving dynamics and function of transient states in single enzyme molecules.
Sanabria, H., Rodnin, D., Hemmen, K., Peulen, T.-O., Felekyan, S., Fleissner, M. R., Dimura, M., Koberling, F., Kühnemuth, R., Hubbell, W., Gohlke, H., Seidel, C. A. M.
Nat. Commun. 11, e1231 (2020)
DOI: 10.1038/s41467-020-14886-w
Titel: Structural and dynamic insights revealing how lipase binding domain MD1 of Pseudomonas aeruginosa foldase affects lipase activation.
Viegas, A., Dollinger, P., Verma, N., Kubiak, J., Viennet, T., Seidel, C. A. M., Holger Gohlke, H., Etzkorn, M. , Kovacic, F., Jaeger, K.-E.
Sci. Rep. 10, e3578 (2020)
DOI: 10.1038/s41598-020-60093-4
Titel: Specific conformational dynamics and expansion underpin a multi-step mechanism for specific binding of p27 with Cdk2/Cyclin A.
Tsytlonok, M., Hemmen, K., Hamilton, G., Kolimi, N., Felekyan, S., Seidel, C. A. M., Tompa, P., Sanabria, H.
J. Mol. Biol. 432, 2998-3017 (2020)
DOI: 10.1016/j.jmb.2020.02.010
Titel: Dynamics of the nucleosomal histone H3 N-terminal tail revealed by high precision single-molecule FRET.
Lehmann, K., Felekyan, S., Kühnemuth, R., Dimura, M., Tóth, K+, Seidel, C. A. M.+, Langowski, J.
Nucleic Acids Res. 48, 1551-71 (2020)
DOI: 10.1093/nar/gkz1186
Dragana Sretenovic ist unsere neue Doktorandin. Herzlich Willkommen !!
Bianca Reschke ist unsere neue Doktorandin. Herzlich Willkommen !!
Archiv - Aktuelles
- Aktuelles 2019
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Olga Doroshenko (links) und Prof. Dr. Claus A.M. Seidel (rechts) 
Olga Doroshenko hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Accurate structural determination of biomolecules via single-molecule high-precision FRET measurements", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Titel: Federating Structural Models and Data: Outcomes from A Workshop on Archiving Integrative Structures.
Structure 2019, 27, 1745-1759
DOI: 10.1016/j.str.2019.11.002Milana Popara gewinnt auf dem EMBO Workshop "Synergy of experiment and computation in quantitative systems biology" in Nové Hrady, Tschechien, einen Posterpreis.
Titel: Integrated approach using NMR, fluorescence and molecular dynamics for multiscale protein dynamics.
Titel: Dynamic anticipation by Cdk2/Cyclin A-bound p27 mediates signal integration in cell cycle regulation.
Nat. Commun. 10, e1676 (2019)
DOI: 10.1038/s41467-019-09446-wMykola Dimura gewinnt auf dem Biophysical Society Meeting in Baltimore, USA, den Posterpreis der Fluorescence Subgroup.
Titel: Automated and Optimally Fret-Assisted Structural Modeling
Nicolaas van der Voort ist unser neuer Doktorand. Herzlich Willkommen !!
Titel: Integrated NMR, Fluorescence, and Molecular Dynamics Benchmark Study of Protein Mechanics and Hydrodynamics.
J. Phys. Chem. B. 2019, 123, 1453-1480
DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b08903
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- Aktuelles 2018
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Soheila Rezaei ist unsere neue Doktorandin. Herzlich Willkommen !!
Titel: High precision FRET studies reveal reversible transitions in nucleosomes between microseconds and minutes.
Nat. Commun. 9 e4628 (2018)
DOI: 10.1038/s41467-018-06758-1
Vermessung der Nanowelt
Forscher etablieren einen Maßstab zur genauen Bestimmung von Abständen innerhalb einzelner Moleküle
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Titel: Precision and accuracy of single-molecule FRET measurements – a multi-laboratory benchmark study
Nature Methods 15, 669–676 (2018)
DOI: 10.1038/s41592-018-0085-0Milana Popara ist unsere neue Doktorandin. Herzlich Willkommen !!
Titel: Single-molecule FRET reveals multiscale chromatin dynamics modulated by HP1α.
Nat. Commun. 9 e235 (2018)
DOI: 10.1038/s41467-017-02619-5
This article has been recommended in F1000Prime as being of special significance in its field by F1000 Faculty
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- Aktuelles 2017
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Alexander Larbig ist unser neuer Doktorand. Herzlich Willkommen !!
Julian van Megen (mitte), Prof. Dr. Claus A.M. Seidel (links) und Prof. Dr. Wolfgang von Rybinski (rechts) 
Julian van Megen hat seine Dissertation, mit dem Titel "Untersuchung der Struktur und Dynamik feinteiliger Emulsionen an fest/flüssig-Grenzflächen mittels hochauflösender Mikroskopie", mit Auszeichnung abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Julian Folz ist unser neuer Doktorand. Herzlich Willkommen !!
Titel: Combining graphical and analytical Methods with molecular simulations to analyze time-resolved FRET-measurements of labeled macromolecules accurately.
J. Phys. Chem. B. 121, 8211-8241 (2017)
DOI: 10.1021/acs.jpcb.7b03441Julian Koch ist unser neuer Doktorand. Herzlich Willkommen !!
Deborah Sandrin hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Analysis of molecular diffusion and photochemistry by quantitative fluorescence correlation spectroscopy", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Titel: Uptake dynamics of graphene quantum dots into primary human blood cells following in vitro exposure
RSC Advances 7, 12208-12216 (2017)
DOI: 10.1039/C6RA27829
Mykola Dimura gewinnt auf dem Biophysical Society Meeting in New Orleans, USA, den Posterpreis der Fluorescence Subgroup.
Titel: Multi-conformation Biomolecular Structure Determination by High-precision FRET and Molecular Simulations
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- Aktuelles 2016
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Titel: Quantitatve FRET studies and integrative modeling unravel the structure and dynamics of biomolecular systems
Curr. Opin. Struct. Biol. 40, 163-185 (2016)
DOI: 10.1016/j.sbi.2016.11.012
Titel: Structural assemblies of the di- and oligomeric G-protein coupled receptor TGR5 in live cells: an MFIS-FRET and integrative modelling study
Sci. Rep. 6, 36792 (2016)
DOI: 10.1038/srep36792Katherina Hemmen (rechts) und Prof. Dr. Claus A.M. Seidel (links) 
Katherina Hemmen hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Structure and conformational fluctuations of Phage T4 lysozyme under native and denaturing conditions", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Titel: Diffusion of macromolecules in a polymer hydrogel: from microscopic to macroscopic scales
Phys. Chem. Chem. Phys. 18: 12860 - 12876 (2016)
DOI: 10.1039/C5CP07781HJan-Hendrik Budde ist unser neuer Doktorand. Herzlich Willkommen !!
Thomas O. Peulen (links) und Prof. Dr. Claus A.M. Seidel (rechts) 
Thomas Peulen hat seine Dissertation, mit dem Titel "Mapping protein Structure and Dynamics by Förster Resonance Energy Transfer in vitro and in live cells", mit Auszeichnung abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Qijun Ma (links) und Prof. Dr. Claus A.M. Seidel (rechts) 
Qijun Ma hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Protein interactions in living cells studied by multiparameter fluorescence imaging spectroscopy", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Titel: Guanylate binding proteins (GBPs) directly attack T. gondii via supramolecular complexes
eLife 5: e.11479 (2016)
DOI: 10.7554/eLife.11479
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- Aktuelles 2015
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Deborah Sandrin gewinnt den Preis für die beste Präsentation auf dem Workshop FCS in Polymer Science an der RWTH Aachen vom 24. -25. September 2015.
Titel: Quantitative experimental and theoretical investigation of diffusion of macromolecules through gel matrices
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Dmytro Rodnin hat seine Dissertation, mit dem Titel "Untersuchung von Proteindynamiken mit Hilfe von Einzelmolekül-Förster-Resonanzenergietransfer", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Aiswaria Prakash hat ein Doktorandenstipendium des DAAD erhalten und kann ihre Doktorarbeit in der MPC anfertigen.
Thomas Peulen gewinnt auf dem Biophysical Society Meeting in Baltimore, USA, den Posterpreis der Fluorescence Subgroup.
Titel: Positional Fluorophore Properties in High-Precision FRET Analysis: Orientation Effects, Dynamic Quenching and Beyond
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- Aktuelles 2014
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Hayk Vardanyan hat seine Dissertation, mit dem Titel "FRET restrained high-precision structural modeling of RNA junctions", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Daniel Rohrbeck hat seine Dissertation, mit dem Titel "Untersuchung der Katalyseeigenschaften und strukturellen Dynamik von Proteinen und Proteinkomplexen mit Einzelmolekül-Fluoreszenzspektroskopie ", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Markus Richert hat seine Dissertation mit dem Titel "Untersuchung von funktionellen Dynamiken in DNA-Strukturen und DNA-Polymerasen mittels Einzelmolekül-Fluoreszenzspektroskopie" erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
Maria Bous gewinnt auf der European Detergence Conference in Fulda einen Posterpreis.
Titel: Study of surfactant structures on solid surfaces directly in solution by high resolution fluorescence microscopy
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Julian van Megen gewinnt auf der European Detergence Conference in Fulda einen Posterpreis.
Titel: Study of adsorption layers of surfactant mixtures on solid surfaces by atomic force microscopy
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Katherina Hemmen gewinnt auf dem Biophysical Society Meeting in San Francisco, USA, den Posterpreis der Fluorescence Subgroup.
Titel: Deciphering Folding Pathways of Phage T4 Lysozyme: Influence of Multiple Conformations
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Stephanie Grabowski hat ihre Dissertation, mit dem Titel "Multiparameter-Fluoreszenz-Image-Spektroskopie von Proteinkomplexen in planta", erfolgreich abgeschlossen. Herzlichen Glückwunsch !!
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- Aktuelles 2013
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